根据流行病学史和典型的皮疹特点就可诊断手足口病。手足口病的常见症状为孩子手、足部、腿部和口腔等部位出现小疱疹或者小溃疡，还有疼痛、厌食、发热等表现，多数在一周内即可自愈。还有少数重症患儿会在发病后出现脑膜炎、肺水肿等并发症。
1、疱疹
手足口病的患儿在口腔黏膜上会出现疱疹或者溃疡，大多位于舌、颊粘膜和硬腭等部位，也可能出现在软腭、扁桃体、牙龈和咽部等地方的黏膜上;患儿的手、臂部、足部、腿部、臀部以及肛周等地方都可能出现丘疹，随后变为小疱疹。疱疹从几个到几十个不等，以手足部最多，通常于1周左右消退，消退后不会留下痕迹。
2、全身表现
由于肠道病毒感染，会引起发热、厌食和口腔疼痛等表现。首先，感染激活了患儿的免疫系统，通常会出现38度左右的低烧。持续性的低烧会让患儿的食欲下降，还可能有头晕头痛、咳嗽、流鼻涕等类似感冒的症状。另外由于患儿的口腔里会有疱疹或者溃疡，因此会出现口腔疼痛的表现，患儿会表现拒绝进食和饮水。
3、其它
少数症状患儿如果出现脑膜脑炎及脑脊髓炎等并发症，会出现嗜睡、头痛、呕吐、昏迷等神经系统表现。如果并发肺水肿，会有呼吸浅快、口唇发绀、呼吸困难、咳嗽等呼吸系统表现。如果并发循环障碍，会出现四肢冰凉、发绀、冷汗及心率异常等表现。
