蒙脱石散起效就是依靠蒙脱石微粒附着粘膜，所以服药的时间一定要保证微粒能够很好的与肠道接触并粘附，从一角度出发，最好就是在两餐之间服药。一来可以保证服药之前胃内食物几乎排空，又能保证服药之后的短时间内不会再次进食影响药物起效。
1、两餐之间服用
蒙脱石散最好的服药时间一定是在两餐之间，距离上一餐吃完和下一餐开始都有一段时间的那个时间点。之所以不同于其他的药物可以随餐服用或者饭前饭后都可以服用的比较随性的方式，还是与它起效的机制有很大关系。蒙脱石散起效的原理，实际上并不是一个化学过程，而更像是一个物理过程，它是通过蒙脱石微粒附着到肠道粘膜上，吸附病原体后随分辨排出，同时保护肠粘膜来起到止泻效果。如果服药前后短时间内又进食的话，会严重影响药物发挥效果，因此最好在食物排空而又短时间内不会再次进食的两餐之间服用。
2、食管炎患者饭后服用
不过上述都是针对于一般腹泻患者，如果说腹泻的人本身是食管炎患者的话，那么服药的时间就不再是两餐之间，而最好是在饭后喝。而且除了能治疗腹泻之外，蒙脱石散还能用于治疗其他的一些疾病，只不过用法用量可能有些不同，像对于治疗急性腹泻的时候，蒙脱石散最好就是立即服用，第一次服药的时候药量还需要加倍，而如果是治疗肠炎等情况，那么还可以保留灌肠。
