在目前的医学水平下，肝囊肿并没有可以直接治愈的药物。在中医中药调理下，也没有确切的临床症状表明可以使肝囊肿消失，不过使用中药疏肝理气、活血化瘀，确实有助于阻止较小的肝囊肿进一步增大，起到预防和辅助治疗的作用。
在临床上，较小的囊肿(直径不超过5厘米)一般不需要特殊处理，也不需要服用药物，只要定期进行复查就好，患者自身也需要养成良好的生活习惯，注意肝功能的保护。较大的肝囊肿(直径超过5厘米)如果引起了明显不适症状，需要进行治疗，主要是超声引导下穿刺抽液，或微创手术等治疗方式，药物治疗主要是控制感染，针对肝囊肿本身没有治疗作用。
由此可见，目前是没有任何药物可以直接治愈肝囊肿，使其消失的。不过在中医指导下，使用中药对肝囊肿患者进行调理，可以在一定程度上阻止或延缓囊肿继续增大，起到预防和辅助治疗的作用。中医认为肝囊肿多由于肝郁气滞，或湿浊之邪和虫积日久导致气滞血瘀，因此可使用疏肝理气、活血化瘀以及化湿导滞的中药进行调理。
在中医辨证指导下，使用郁金、桂枝、桃仁、牡丹皮和茯苓等中药，或者沙麦膏和桂枝茯苓丸等中成药，有助于梳理郁结的肝脏气机，祛除阻滞于经络中的湿邪，使得瘀滞的气血恢复正常运行，从而起到导滞散结之功效，也就是对肝囊肿起到一定的辅助治疗作用。
