肝囊肿一般不会变成肝癌。大部分肝囊肿是由于先天性肝内胆管发育异常所致，还有小部分是由于炎症、创伤、肿瘤和寄生虫等因素所致，癌变的风险极低。只有极少数患者是由于本身就是囊腺癌等恶性肿瘤因素所致的肝囊肿。因此患者不用过分担心。
首先患者需要明白，肝囊肿和肝癌是两种不同的疾病。肝囊肿大多数是肝脏的良性病变，而肝癌是恶性病变。其次，肝囊肿绝大多数是由于先天性的肝内胆管发育异常所致，导致管腔内的胆汁等液体滞留而形成，大约占到所有肝囊肿患者的90%，这种肝囊肿是不会癌变的，只可能合并感染、出血等并发症。
肝癌是由于肝脏细胞癌变或者其它部位癌细胞转移到肝脏所致，与肝囊肿的发病机制完全不同。极少数患者由于本身就是囊腺癌等恶性肿瘤所引起的肝囊肿，才会让人误以为是肝囊肿癌变了，其实是恶性肿瘤引起了肝囊肿，而非肝囊肿发展为肝癌。
总的来说，肝囊肿不会转变为肝癌，但恶性肿瘤可以引起肝囊肿，因此患者不必担心肝囊肿的癌变风险。肝囊肿这种疾病的预后很好，大部分患者不用进行治疗，只有约5%的患者需要治疗，而且绝大多数通过手术可以治愈，只有少数患者因为年老如弱和心、肾等重要脏器功能不全而不能耐受手术，因此只能通过其他手段缓解不适症状。
