客观而言，尽管中药减肥好处多多，但也不可忽视中药减肥带来的毒副作用。因为用于减肥的中药，大多性质寒凉，长期服用容易引起生理功能失衡。尤其滥用中药减肥，不经医嘱擅自服用所谓 偏方、验方等，或是仅采用具有泻下、利尿作用的药物，排出体内水分，造成细胞脱水，达到短暂的减肥效果的方法，将会出现腹泻、腹胀、恶心、呕吐、头痛、胸闷、晕厥和电解质紊乱。
有些爱美女性在长期服用中药减肥药后，导致月经失调，有些服用中药减肥的人，因过度服用减肥药，导致身体免疫力降低，给身体健康带来隐患，得不偿失。
这些现象告诉我们，过度服用性寒的中药，常可导致生理功能的失衡，所以，药物减肥应是不得已时才使用的，而且最好是在医生指示下服用。
此外，用于减肥的中药汤剂有很多，比如荟桂术甘汤、九味半夏汤、桂枝茯苓丸、麻仁丸、荷叶散等。肥胖者体质状况较为复杂，有时同时合并有其他证型，需要两种或三种药物方案配合使 用，才能提高疗效。药物煎服方法不当，减肥效果会差或者出现副作用，在服用这些中药减肥药物时，要注意药物的煎服方法，该先煎则先煎，该后煎则后煎，包煎的药物不能混煎。
