胃镜不能检查出幽门螺杆菌，它主要是用来检查上消化道黏膜的病变，比如炎症、溃疡和肿物等。幽门螺杆菌是一种小于2微米的细菌，胃镜无法帮助医生看到这种细菌。如果想要检查幽门螺旋杆菌，最简便的方法就是碳13或碳14呼气实验。
胃镜是一种影像学检查的方法，其主要是用于检查食道、胃部和十二指肠的黏膜有没有发生病变，包括黏膜的炎性改变、溃疡、息肉以及肿瘤等。胃镜可以让医生直接看到被检查部位的情况，还能够发现微小的病变。一旦胃镜发现可疑的病变，需要做进一步的检查。
幽门螺旋杆菌是一种细菌，小于2微米，肉眼是无法看见的。显微镜只有放大400倍以上，才能够让人的眼睛看到细菌。即便是目前最可靠的电子胃镜，其放大倍数也只在115倍左右。因此，胃镜根本就无法看到微生物，更不用说清晰地看到幽门螺旋杆菌。
如果想要检查幽门螺旋杆菌，目前最简便的方法就是碳13或碳14呼气实验，如果检查结果为阳性，就说明有幽门螺旋杆菌感染。另外，还可以进行胃黏膜组织的快速尿素酶实验、幽门螺旋杆菌培养或者胃黏膜组织切片等检查，这三项中有任何一项为阳性，都可以诊断为幽门螺旋杆菌感染。
