益生菌和酸奶可以一起吃，因为许多酸奶饮品中本就含有大量益生菌，两者合用并不会产生有害物质，只要注意用量即可。如果患者吃益生菌的目的是缓解腹泻、便秘等不适，症状消失后就可以停止用药了。长期食用益生菌和酸奶可以对人体造成不利影响。
益生菌泛指对人体有益的活性微生物，比较常见的益生菌产品包括乳酸菌素片、整肠生、双歧杆菌微生态制剂、双歧杆菌果汁饮料等，现在的许多酸奶饮品中也含有活性益生菌，比如双歧杆菌酸奶，益生菌当然是可以和酸奶一起吃的。
如果患者想通过服用益生菌来调理肠内环境，需要按照益生菌制剂的使用说明用药，比如用药前后不能饮用温度过高的热水，也不能与阿莫西林、阿奇霉素、青霉素、头孢等抗生素合用，以免高温和抗菌药使益生菌失去活性，因为只有活菌才能顺利定殖于肠道并参与肠内菌群的调节。
不管是普通酸奶还是益生菌酸奶，都不能长期过量摄入。普通酸奶本身有一定热量，长期使用可能会导致患者脾虚胃寒或体重增加;长期食用人工合成的益生菌产品会扰乱肠道菌群平衡，导致人体肠道自我调节功能减弱。
