目前在临床上，针对幽门螺杆菌感染，标准的治疗方法就是三联或四联药物治疗。三联药物治疗就是一种质子泵抑制剂和两种抗生素，而四联药物治疗是在三联的基础上加入了一种铋剂。由于个体差异，每个患者的具体用药方案也有所不同。
1、HP根除治疗
HP根除治疗也就是幽门螺杆菌的三联或四联药物治疗，目前在临床上是治疗幽门螺杆菌感染最常用的手段，以阿莫西林、甲硝唑、克拉霉素、左氧氟沙星等抗生素为主，辅以质子泵抑制剂和铋剂，也就是抑酸药和胃粘膜保护药。由于每个患者的具体情况不同，对抗生素敏感性也不同，因此具体的药物治疗方案也是不一样的。
2、必要时手术治疗
大多数患者通过药物治疗后是可以治愈的，但少数患者可能需要手术治疗。比如难治性的胃溃疡，反复发作，引起大量出血，经过内科治疗无效者。或者是巨大的胃溃疡，或者是高度怀疑恶变、已经发展为肿瘤者，都需要手术治疗。
3、其它
目前发现，在进行幽门螺杆菌的根除治疗的同时，使用益生菌，可以有效抑制幽门螺杆菌，提高治疗效果。如果联合中医药治疗，也能够提高患者自身的抵抗力，减轻不适症状，提高幽门螺杆菌的根除率。
